知能情報システム工学専攻には、以下の研究室が所属しています。研究内容については、研究室のページをご覧ください。

• 張 亜 研究室

• 鄧 明聡 研究室

• 白樫 淳一 研究室

• 久保 若奈 研究室

• 上野 智雄 研究室

• 梅林 健太 研究室

• 鈴木 健仁 研究室

• 藤吉 邦洋 研究室

• 清水 昭伸 研究室

• 瀧山 健 研究室

• 田中 聡久 研究室

• 矢田部 浩平 研究室

• 飛嶋 隆信 研究室

• 岡野 一郎 研究室

• 金子 敬一 研究室

• 宮代 隆平 研究室

• 藤田 桂英 研究室

• 渡辺 峻 研究室

• 中山 悠 研究室

• 岩崎 裕江 研究室

• 早川 諒 研究室

• 近藤 敏之 研究室

• 清水 郁子 研究室

• 山井 成良 研究室

• 中條 拓伯 研究室

• 堀田 政二 研究室

• 藤田 欣也 研究室

• 高瀬 恵子 研究室

• 山田 宏樹 研究室

• 並木 美太郎 研究室（博士後期課程のみ）

• 山田 浩史 研究室（博士後期課程のみ）

• 宇野 良子 研究室

• 原 伸生 研究室

• 村田 実貴生 研究室

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なお、以下の研究室は工学部の知能情報システム工学科に所属していますが、大学院における所属は知能情報システム工学専攻ではないので、ご注意ください。​​

• 有馬 卓司 研究室（生物システム応用科学府） 

• 藤波 香織 研究室（生物システム応用科学府）

• 古宮 嘉那子 研究室（生物システム応用科学府）